La biodiversité des milieux agricoles est à la fois un indicateur de la santé des écosystèmes et une ressource fonctionnelle pour l'agriculture. Haies, prairies permanentes, zones humides, bandes enherbées : ces éléments du paysage agricole hébergent des auxiliaires des cultures, filtrent les eaux et stockent le carbone.

Ce thème rassemble les méthodes d'inventaire de la biodiversité, les protocoles standardisés d'évaluation des haies et du bocage, les méthodes d'évaluation d'impact environnemental et les diagnostics de la qualité des ressources en eau et en sol.